Por padrão, o Nautilus não mostra alguns arquivos de sistema e de backup nas pastas. Isto previne que eles sejam modificados ou excluídos acidentalmente (comprometendo o funcionamento do computador), e também reduz a desordem em locais como a sua Pasta Pessoal. O Nautilus não mostra:
Você pode ocultar ou mostrar arquivos ocultos numa pasta em particular selecionando Ver ▸ Mostrar Arquivos Ocultos.
Para configurar o Nautilus para sempre mostrar arquivos ocultos, veja a Seção 6.12 ― Preferências do Nautilus.
Para esconder um arquivo ou pasta no Nautilus, renomeie o arquivo de forma que o seu nome comece com um ponto (.), ou crie um arquivo de texto chamado .hidden na mesma pasta, e adicione o nome do arquivo a ele, como no exemplo abaixo:
nome do arquivo nome da pasta
Você pode precisar atualizar a janela Nautilus em questão para ver a alteração: pressione Ctrl+R.